Ученые РФ раскрыли механизм работы природного антибиотика

Сотрудники Московского физико-технического института (МФТИ) совместно с коллегами впервые раскрыли механизм природного антибиотика низина, что в дальнейшем позволит создавать новые эффективные антибиотики. Об этом в среду сообщила пресс-служба МФТИ."Ученые из Института биоорганической химии им. М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, МФТИ и ВШЭ исследовали взаимодействие известного природного антибиотика с его мишенью с помощью молекулярного моделирования. Эти данные помогут разработать эффективные антибиотики нового типа. Результаты опубликованы в журнале Scientific reports", - говорится в сообщении.В микробиологии известны небольшие антимикробные белки, называемые лантибиотиками, которые обладают бактерицидным потенциалом. Наиболее изученным из них считается низин. Низин никогда не использовали в клинической практике из-за нестабильности в организме человека, однако он широко применяется в качестве пищевого консерванта.Известно, что этот лантибиотик эффективно борется, в первую очередь, против бактерий с однослойной мембраной. Но также есть сведения, что он активен в сочетании с ионами металлов и против нескольких штаммов с двухслойной стенкой.Лантибиотик, как пояснили в МФТИ, убивает бактерии путем разрушения мембраны и остановки синтеза клеточной стенки. Он активно взаимодействует со специфической мишенью в мембране клетки - липидом II. Несмотря на известность и активное использование в пищевой промышленности, механизм антимикробного действия низина на атомном уровне остается неизученным.В новой работе ученые смогли выяснить, какие конформации (состояния) низина могут образовывать комплекс с липидом II. А также смогли сконструировать предполагаемый комплекс модуля распознавания низина с липидом II в модельной бактериальной мембране, который оставался стабильным в течение длительного периода моделирования. Оказалось, что низин образует стабильный комплекс с двумя конформациями."Таким образом, становится понятно, как нужно расположить молекулу антибиотика, чтобы она подействовала так же, как низин, или даже более эффективно. Разработанная нами модель связывания упростит поиск молекул-кандидатов, которые потом можно будет экспериментально исследовать на эффективность против бактерий", - отметил один из авторов исследования Роман Ефремов.Читайте также:Вирусы-пожиратели бактерий: как предшественники антибиотиков помогали в годы войныРосздравнадзор не выявил особых отличий в препаратах для лечения муковисцидозаТаблетки для мира: как Россия осваивает зарубежные фармрынки

Также по теме: